Die Verknüpfungstechnologie in MyMenta bildet den funktionalen Kern des Systems. Die mit Abschluss einer beliebigen Änderung durchgeführte sofortige Aktualisierung aller betroffenen Verknüpfungen ist eine wichtige Grundlage für das frei modifizierbare, aktive Wissensmodell.

Verknüpfungen entstehen durch Auswahl eines zu verknüpfenden Begriffs, ein oder mehrere Worte im Text eines Memos, und durch Einschließen in eckige Klammern über den Befehl "Klammern".
Jeder neu erstellte Verknüpfungsbegriff erhält automatisch den Typ "leer" und erscheint in einer Verknüpfungsliste. Aus dieser Liste heraus erfolgt die Bearbeitung oder Änderung. Es wird zunächst ein Verknüpfungstyp zugewiesen. Folgende Typen stehen zur Auswahl:

• leer - automatische Zuweisung für jeden neuen Verknüpfungsbegriff -> AKTION: keine
• Inhalt - verweist auf Memos -> AKTION: aus einer Liste wird ein Memo ausgewählt
• Gruppe - verweist auf eine Thematik -> AKTION: aus einer Liste wird eine Thematik ausgewählt
• Thesaurus - der Begriff erscheint im Thesaurus -> AKTION: keine
• Termin -> AKTION: Auswahl oder Eingabe eines Termines mit Datum und Zeit
• Bild - Verweise auf Fotos -> AKTION: Auswahl eines Foto Objektes

Alle Verknüpfungen werden jeweils am betroffenen Wissensobjekt als Von- und Nach-Verweis angezeigt.
Leere Verknüpfungen werden in einer gesonderten Liste in der Übersicht des Systems angezeigt, aus der sie erst entfernt werden, sobald ein anderer Verknüpfungstyp ausgewählt wird. Somit können die "beziehungslosen" Wissensobjekte nicht verloren gehen und warten an exponierter Stelle auf eine Bearbeitung.